一頭熊跳到了水裏。在熊游泳的過程中，為了呼吸，就把嘴張得越來越大、頭越抬越高，試圖讓鼻子露在外面。隨着頭越抬越高、嘴張得越來越大，遊著遊著，這頭熊就變成了鯨魚。
這個故事顯然非常可笑，對吧？然而，這就是達爾文進化論的全部基礎和結論，他的基礎就是熊遊著遊著就會變成鯨魚，他的結論也是熊游著游著就會變成鯨魚。
這是達爾文在《物種起源》第一版講述的故事。達爾文自己都覺得它實在太過荒謬，在再版《物種起源》時，他偷偷刪掉了這個故事。
說實在的，我對進化論是一直心存懷疑的。我的出發點非常簡單：如果人是猿進化而來的，那麼猿爲什麼不進化？
關於進化論的話題，就像中醫，非常容易引起爭議，好像是信者恆信、不信者恆不信。
但是，希望你能夠放下陳見，看一看本文。
一、科学必须能够证伪
接受唯物主義教育的人們，往往宣稱自己相信科學。其實相當程度上，科學和宗教的性質是一樣的，它們都屬於信仰。
為什麼這麼說？
科學和信仰都存在著兩個共同的特點：
1. 建立於公理之上的體系。
比如歐氏幾何，就基於歐幾里德所提出的幾個公理，如兩點之間一定能做一條直線、平行線永不相交等。為什麼它們是公理？因爲是不證自明的，不需要證明。你不能挑戰公理，挑戰之後歐氏幾何就不成立了。
公理無需證明，其實就變成了一種信仰。同樣地，有神論宗教認爲神是存在的，也不需要證明，信衆就是相信。
認爲一個東西無需證明就永遠正確，這實際上就是一種信仰。
2. 科學是可以證偽的。
研究科學的系統方法，稱爲scientific reasoning。簡單地說，就是通過大量的觀測提出一些問題，然後通過假說來解釋這些問題。
比如，為什麼你推一下面前的桌子，它就會被推動？這就涉及到一些力學問題，力學會給你一些解釋，並將其中的規律量化成數學公式。然後，你再進行實驗驗證，在驗證過程中可能需要對你的理論進行某種程度的修正。這個過程就是scientific reasoning。
scientific reasoning就是科學的思維方式，它是可以證偽的。也就是說，可以證明結論反面的存在。
比如，你去觀察天鵝，調查了1萬多只歐洲天鵝，發現每一隻都是白色的。這就是大量觀測。然後你提出一個假說：所有天鵝都是白色的。這個假說對嗎？只要能找到一隻黑天鵝，就可以把這個假設推翻。
由此可見，科學的論斷並不是真理，科學本身一直都在不斷地修正。每當發現一些新的現像、一些科學解釋不了的東西，就需要對原來的理論體係進行修正。這個過程，也就是科學自我完善的過程。
二、进化论是一种假说
根據科學研究的思維方式，你就知道：進化論只是提出了一種假說，並沒完成整個scientific reasoning的過程。
因為進化論無法驗證。你沒有辦法通過具體的觀測，研究幾十億年來地球上物種所發生的變化，從而證明進化論是對的。你也不可能找到一個現實生活中的具體示例，證明一條魚變成了青蛙。
科學是一個不斷完善的過程，是人們對觀測現象的總結。比如，牛頓坐在樹下被一顆蘋果砸到了[這個故事真僞暫且不提]，牛頓就開始研究為什麼所有的蘋果都會落向地面，於是提出了萬有引力定律。提出這種假說之後，再進行驗證，每次驗證都證明牛頓的假說是對的。於是，牛頓的理論就被認為是科學。
但是牛頓的理論並不是真理。當你離開宏觀世界進入微觀世界時，你會發現經典力學已經不成立了，你需要愛因斯坦的相對論和普朗克的量子力學。
然而相對論和量子力學之間也存在很多爭論。量子力學認為，粒子的存在位置、運動狀態都是模糊的，是概率事件。比如電子的自旋方向是正轉還是反轉，必須去觀測才能確定，觀測之前這個狀態是不確定的。這和愛因斯坦的相對論是衝突的，愛因斯坦認為上帝是不擲骰子的。
科學家們認為宇宙已經存在138億年，人們所能夠觀測到時間和空間相對於宇宙來說是微不足道的。即使觀測了1000萬顆恒星，發現全都符合愛因斯坦的廣義相對論，你仍然不能夠肯定地說廣義相對論始終是對的。說不定明天、明年，就有人發現一個恒星的運行是不符合廣義相對論的。
作爲一種假說，達爾文(Charles Darwin)1859年發表的《物種起源(On the Origin of Species)》，基本概念包括以下四點：
- 過度繁殖：任何一個物種都會不斷地生育，使種群的數量不斷擴大。
- 生存競爭：當一個種群的數量非常龐大時，可能就面臨著食物不足的問題，還可能遭遇天敵襲擊，為了能夠生存下來，它們就必須不斷地適應環境。
- 遺傳和變異：適合生存的特徵通過遺傳保留下來，不適合生存的特徵通過基因突變[當然達爾文時代還沒有基因突變的概念]來發生變化，不斷地適應環境，去除那些不適合生存的特徵。
- 適者生存：隨著時間的推移和不斷的優化，最後能夠生存下來的都是能夠適應環境的品種。
這基本上就是進化論的全部理論假說。但是，進化論假說很多問題，遭遇了比較解剖學、胚胎重演律、古生物學、分子生物學和進化論實驗的挑戰。
三、比较解剖学不能验证进化论
比較解剖學的思路是：發現很多生物化石後，比較它們互相之間相似性，從而建立進化的鏈條。比如，猿和人的相似度要比魚和人相似度高，就認為猿和人之間的進化距離比較短，也就是在進化樹上人和猿的關係更加接近。
比較解剖學實際上是一個邏輯錯誤。它等於說：如果人是猿進化而來的，那麼猿和人應該有相像之處；因爲猿和人有相像之處，所以人是猿進化而來的。
學過簡單的邏輯就知道，原命題和逆命題是不等價的，能由A推導出B，並不能反過來由B推導出A。
所以，比較解剖學陷入了循環論證的邏輯錯誤：因為猿跟人比較像，所以人是從猿進化而來的；因為人是從猿進化而來的，所以人跟猿是比較像。
如果這種論證能夠成立，那麼可以證明Macbook是從PC進化而來的。Macbook跟PC比較像，而且又出現得比PC晚，所以經過了大約10年時間，PC就進化成為Macbook。
這當然非常可笑。顯然，並不是PC進化成了Macbook，而是後面有不同的人在設計，有人設計了PC、有人設計了Macbook。
四、胚胎重演律不能验证进化论
19世紀，德國生物學家海克爾(Ernst Haeckel)提出了胚胎重演律。海克爾認為，高等生物的胚胎發育會重現該物種的進化過程。
他的假設是，如果人是進化而來的，人的胚胎發育過程中就重演進化過程，也就是胚胎在不同的發育階段會出現魚類、兩棲類、爬行類動物的樣子，最後變成人形。
這是一個非常無厘頭的假設。憑什么上億年、幾十億年的進化過程，在短短的十個月或三、四個月就會重演一遍？進化和胚胎發育沒有必然的邏輯聯繫。
但是海克爾出示了一組進化論的證據。海克爾用一些圖片進行比較，說：你看人類的胚胎，在不同階段顯示出和魚、烏龜、小雞、豬和兔子的胚胎看起來很像。所以，人是進化而來的，而胚胎發育過程就是對自身進化過程的回憶。
看起來好像是那麼回事，你感覺好像魚一步一步的就進化成人了，中學老師也是這樣教給你的。但是，海克爾給每個生命只列出了三個胚胎，應該是豎著看、而不是橫著看的。
而且海克爾犯下了與比較解剖學相同的邏輯錯誤：因為人是進化來的，所以胚胎會重演；因為胚胎重演了，所以人是進化來的。同樣的循環論證，同樣的把原命題和逆命題等價。
海克爾並不是一個嚴肅的學者。海克爾的圖片並不是真正的胚胎圖樣，海克爾是“PS”過的，他修改了不符合結論的圖片。在繪製胚胎圖片時，他有意進行了大量的誇張、變形和刪除，誇張程度甚至高達10倍以上，以便使人的胚胎和其他胚胎看起來很像。比如，他誇大了人的一些器官、去掉了一些器官，使人長得跟豬差不多。
更致命的是，人的胚胎發育過程根本就沒有出現重演率。如果不是故意僞造，海克爾也犯下了觀測錯誤。德國人類胚胎學家布萊特施密特(Erich Blechschmidt)，在他的著作《人的生命之始(The Begining of Human Life)》中，以詳盡的資料證明，人的胎兒從一開始就都是人的結構。海克爾所謂的“鰓裂”，其實是胎兒臉上的皺褶；尾巴其實是中空的神經管，而且它的作用很重要，根本不是什麼殘跡器官。
其實，你從常識也能判斷出，海克爾完全是編造謊言。試想，如果他是對的，那麼懷孕時間不足的胎兒，早產的時候爲什麼不是長得像魚、像鳥或者兔子？
英國胚胎學家李察遜(Richardson)組織了17家機構的科學家，研究了50種不同脊椎動物的胚胎生長過程，仔細觀察和記錄之後，聯名在1997年8月的Anatomy & Embryology學報上發表了驚人的研究成果：海克爾的胚胎是生物學上最著名的騙局。
他們在海克爾任教的大學找到了他研究重演律的論文，同時發現海克爾是被大學處分過，原因就是他在胚胎圖片上造假。1997年9月5日，美國頂級權威科學論文期刊Science發表了他們的論文Haeckel’s Embryos: Fraud Rediscovered。
五、古生物学不能验证进化论
進化論的古生物學證據，就是能夠畫出一棵進化樹。進化論者認為生命是進化而來的，所以生命就有一個從簡單到復雜、從低級到高級的發展的過程。
於是進化論信奉者通過化石的歷史年代，勾勒出一幅生命由簡單到複雜、隨年代而出現的進化時間表，從最開始原始的單細胞生物變成多細胞生物，然後變成脊索動物門、脊椎動物亞門等等，門綱目科屬種，最後一步一步進化到人。這就是進化樹。
在進化樹上，各個物種都很容易找到祖先，通過樹枝往回找就能會不同物種的共同祖先。
但是隨著化石出土的不斷增加，進化樹就變得越來越亂，本來應該是在樹頂才出現的生物，卻在樹根已經出現了。這迫使人們對進化時間表和進化樹不斷地進行修改和更新，以保持理論和論據的一致。然而現在，面對許多新的事實，這種修改終於來到無法進行下去的地步。
非常典型的一個例子就是寒武紀生命大爆發(Cambrian Explosion)。寒武紀大爆發是相對短時期的進化事件，開始於距今5.41年前的寒武紀時期，化石記錄顯示，絕大多數動物“門”都在這一時期出現了。它持續了接下來的2~2.5千萬年，導致了大多數現代動物門的發散，造成了大量較高等生物以及物種多樣性。
在500~2500萬年之間，幾乎所有的生物都突然同時出現了。按照生命進化的漸進過程，不是應該慢慢進化、由簡單到複雜一步一步的演進嗎？但在寒武紀，突然之間出現了生命大爆發。
在全球各地發現的許多化石羣，共同印證了這一生命進化史上的壯觀景象，例如1084年中國雲南的澄江化石、加拿大的伯吉斯頁岩等等。
這種景象是達爾文進化論回答不了的，其實達爾文本人也知道。他在《物種起源》中非常明確地寫過，進化論沒有辦法解釋這種生命大爆發的現象，也許人們可以用它來推翻進化論。換句話說，達爾文自己也認為物種起源只是一個假說，是有待於未來的驗證的。
六、分子生物学不能验证进化论
達爾文說，熊游泳時嘴張得越來越大、頭越抬越高，慢慢就變成了鯨魚。這種說法並不能解釋物種的變化，它屬於“用進廢退”的邏輯，就是說：你總是使用一個器官，它就會變得發達；你總也不用，器官就會退化。比如有人認爲，鹿要吃到高處的樹葉就得不斷伸長脖子，最後就變成了長頸鹿。
這種說法非常荒謬。後天鍛鍊得到的技能再強大，也不可能遺傳到下一代。因爲再怎麼抻脖子，基因是不會發生變化的，而基因沒有發生變化，後來還得從頭抻起。正如長頸族婦女用銅環把脖子拉長，她們的孩子並不會生來就是長頸。
同樣地，你不斷地鍛煉身體、你的肌肉越來越發達，但你的孩子不會生來就肌肉發達。你就算玩命鍛鍊，把每天做的俯臥撑從100個增加到1000個，你的基因也不會發生變化，把1000個俯臥撐的能力遺傳給你兒子。
基因學說出現之後，人們好像找到了救命稻草，認為生物進化是因為發生了基因突變。當基因發生變化的時候，生物就會展現出與過去完全不同的特徵。
那麼，有沒有一種可能，在食物不足的情況之下，一些鹿發生了基因突變，就了長頸鹿？
很遺憾，從基因突變的概率上分析，卻證明了進化論是不可能的。
美國生物化學家貝希(Michael Behe)1996年出版了《達爾文的黑匣子(Darwin’s Black Box)》一書，從生命結構的複雜性和精密性等多方面，否定了進化論的可能性。他認爲：即使僅從原理上，生物系统也是无法通过自然选择而发展出來的，对于这种复杂结构，唯一可能的解释是它们是由“智能设计师”创建的。
貝希給出了通過基因突變造成物種變化的概率公式。這是一個很寬鬆的公式，根據基因突變的機率來計算進化產生新物種的概率：
生物的基因是很穩定的，雙螺旋結構的DNA在整個遺傳的過程中的基因遺傳信息是很難改動的，因此在遺傳過程中發生突變的概率是很小的，M給出0.01已經相當寬鬆了。
突變之後的基因需要與其他的基因相容。一個基因出現之後，有可能表達(合成某一種特別的蛋白質)，也有可能不表達(沒有起到任何的作用)。突變產生的新基因如果跟其他基因不相容，細胞就會被其他細胞排斥掉。在此過程中存在有很多變數，突變基因必須正好出現在遺傳細胞之中才有可能遺傳。
基因突變通常來說都是造成病態，例如白化病、唐氏綜合症等。基因突變通常不是進化而是退化，基因突變恰好帶來進化的機率非常非常小。
按照這樣的寬鬆估算，一個物種通過基因突變變成另外一個物種的概率，是10的負110次方。概率上說，這就是完全不可能的。
在上面的估算中，物種之間的差別僅用了10個基因，這其實也是完全不可能的。人的基因大約有2.5萬個，人和猿之間的基因差別大約是4%，也就是大約1000個基因是不同的。代入上面的公式，從猿到人的進化概率又縮小了10的100次方倍。因此從概率上，從一個物種變成另外一個物種根本就是不可能的。通過基因突變從一個物種變成另外一個物種，就好像是一隻大猩猩在打印機上一通亂敲，最後打出了一本莎士比亞全集。
基因突變有一個無法回答的問題，就是沒有中間物種。假如猿與人之間相差10個基因，那麼它是通過了10次基因突變而來的，變異1個基因、2個基因的猿在哪裏？目前從地殼化石中根本找不到這樣的中間物種。
基因突變學說還有一個內在矛盾，就是進化的速度。從目前的化石來看，越簡單的生物進化速度越慢，例如原生病毒進化成為單細胞生物、從單細胞生物變成多細胞生物，時間跨度是幾十億年，然而一旦進入到哺乳動物，從猿變成人的速度就突然加快，只需要幾百萬年的時間。但是分子生物學又認為，越高級的物種基因越穩定、越不容易變異，因此進化速變應該越來越慢才對。
基因突變學說還忽略了一個嚴重問題：地球上的生物是是一個非常複雜的生態系統，一個物種的是不能夠單獨生存的。 假如地球上只有一隻兔子，兔子肯定得餓死；假如地球上草很多而且只有兔子，兔子也得死，因為沒有天敵的兔子會越來越多，最後把草吃光時兔子也都餓死了。因此，地球上如果沒有一個複雜的生態系統、不能夠達到物種之間的平衡，物種的延續是不可能的。
七、实验不能验证进化论
從1988年2月24日開始，美國科學院院士、密西根州立大學教授蘭斯基(Richard Lenski)啓動了一項實驗，希望通過大腸杆菌找到進化論的證據。這一實驗已經進行了32年。
蘭斯基教授的想法是，通過實驗觀測一個生物，檢驗是否能夠經過若干代的繁殖之後發生變化。因為基因突變通常發生在生物的繁殖過程中，DNA或RNA複製時造成某一錯誤而產生基因突變，這樣基因突變就傳遞給下一代了。如果能找到一個繁殖非常快的生命，就可以觀察它繁殖很多代之後，有沒有發生基因突變、有沒有變成其他物種。
蘭斯基教授找到了大腸桿菌。大腸桿菌的繁殖速度非常快、極為驚人，在合適的生長條件下，它12.5~20分鐘便可繁殖一代，每小時可分裂3次、由1個變成8個，一天之內可以繁殖72代。
一天繁殖72代，從1988年到現在的32年中，大腸桿菌已經繁殖了55萬代。如果按照人類每20年繁殖一代的速度來推算，這相當於人類已經經過了1100萬年。這是一個足以在進化論中產生新物種的時間尺度，足以讓猿進化爲人。
在如此漫長的時間中，如果大腸杆菌能夠進化出新的基因、蛋白質、甚至變成多細胞生物，那麼進化論就得到了最有力的實驗證據。
然而，大腸桿菌還是大腸桿菌，沒有發生變化。蘭斯基教授沒有看到任何進化的跡象，大腸桿菌沒有產生新的基因、沒有產生新的蛋白質，更沒有變成另外一種組織結構，從單細胞變成多細胞生物。
一般覺得，大腸桿菌是一種非常簡單的低級生物。但是其實這種生物是非常高級的，高級到你無法想象、更做不出來的程度。
美國猶他大學、加州理工學院和英國帝國理工學院的研究人員發現，大腸杆菌的菌體上附有呈波狀彎曲的細長絲狀物，少則一兩根、多則數百根。這些絲狀物稱爲鞭毛，是細菌的運動器官。
細菌鞭毛是自然界最小的納米馬達之一，只有25納米，每分鐘轉速高達6萬轉(汽車發動機和計算機硬盤的轉速只有幾千轉)。爲了發揮正常功能、推進細菌運動，鞭毛需要分組控制和協同配合。
2017年4月14日，Science雜誌發表了他們的研究成果。
八、进化论是真的吗？
簡單的低等生物大腸桿菌，器官竟然是精密的納米級的發動機，這真是難以想象。它是如何進化而來的？
從生命的精妙程度和複雜性、從物種的生態系統，以及對生命繁殖過程中的觀察，都不能驗證進化論的正確性。比較解剖學的形式邏輯錯誤、胚胎重演律造假、分子生物學的概率計算，更加無法驗證進化論。
所以在科學上，進化論只是一種假說，或者說是一種信仰。但是這種信仰已經成爲主流科學界的共識，變得不可質疑。懷疑和證僞進化論的學者，總是遭到主流學界的打壓和迫害，被指斥爲僞科學。進化論好像是一種不可動搖的迷信。
如果進化論不是真的，那麼人是從哪裏來的？哲學和神學可以作出回答。本文就不討論這方面的話題了。